Per "cambiare disco" devi necessariamente uscire dal gioco ed avviare l'altro EBOOT. Alcuni giochi permettono il salvataggio alla fine del primo disco, così puoi benissimo uscire ad avviare l'altro EBOOT.
Altri giochi invece hanno bisogno di un cambio "al volo", quindi non puoi uscire. Per ovviare a questo problema esiste il
Popstation_md, è un'applicazione per PC che ti permette di unire i giochi MultiDisk in un unico EBOOT.