I file dell'aggiornamento li hai messi nel percorso ms0:/PSP/GAME/UPDATE della Memory Stick? ricorda che in quel percorso devi mettere anche l'EBOOT del Firmware 3.90 Ufficiale rinominato in 390.pbp
Per il problema delle ISO, entra nella
Recovery, vai in "Advenced" e seleziona l'opzione "Format flash1 and reset settings"